В 1871 году была образована Туркестанская епархия с центром в городе Верном (ныне – город Алма-Ата). В 1916 году из ее состава было выделено отдельное Верненское викариатство.
5 июня 1945 года была образована Алма-Атинская и Казахстанская епархия, преобразованная 31 января 1991 года в три самостоятельные епархии: Алма-Атинско-Семипалатинскую, Уральско-Гурьевскую и Чимкентско-Акмолинскую.
В 1999 году, принимая во внимание столичный статус города Астана, Алма-Атинско-Семипалатинская епархия была переименована в Астанайскую и Алма-Атинскую.
В настоящее время епархия объединяет приходы и монастыри на территории городов Астана и Алма-Ата, а также Алма-Атинской области.
Границы епархии совпадают с территорией Алма-Атинской области с епархиальном центром в Алма-Ате.
В пределах епархии проживает 4,275 миллиона человек.
Серафимо-Феогностовская Аксайская мужская пустынь
- Адрес: 040900, Республика Казахстан, Алма-Атинская область, город Каскелен, ул. Абая, 65
- Телефон: (+7 72771) 40-60-07
- Наместник: игумен Трифон (Печковский Валерий Анатольевич)
Спасо-Силуанова Есикская мужская пустынь
- Адрес: 040400, Алма-Атинская область, Енбекшикский район, город Иссык, урочище Казачья щель
- Телефон: (+7 72775) 290-84-30
- Наместник: игумен Назарий (Марков Александр Григорьевич)
Женский монастырь в честь иконы Божией Матери «Взыскание погибших»
- Адрес: 010000, город Астана, проспект Республики, 12В
- Телефон: (+7 7172) 53-69-67
- Настоятельница: игумения Рафаила (Василенко)
Иверско-Серафимовский женский монастырь
- Адрес: 050002, город Алма-Ата, ул. Латифа Хамиди, 30
- Телефон: (+7 727) 397-41-05
- Настоятельница: игумения Любовь (Якушкина)
Алма-Атинская православная духовная семинария
- Адрес: 480014, город Алма-Ата, микрорайон «Дорожник», 29
- Телефон: (+7 727) 98-96-04, факс 98-94-15